Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfaP20033 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms