Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NelfeP19426 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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