Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp1P11438 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp1P11438 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms