Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cxcl2P10889 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cxcl2P10889 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cxcl2P10889 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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