Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms