Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnfP06804 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnfP06804 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TnfP06804 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TnfP06804 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TnfP06804 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TnfP06804 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms