Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P06330 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06330 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06330 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06330 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms