Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P04212 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P04212 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04212 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04212 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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