Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01678 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01678 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01678 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01678 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms