Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Serf1O88892 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms