Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Foxq1O70220 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Foxq1O70220 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Foxq1O70220 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Foxq1O70220 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Foxq1O70220 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Foxq1O70220 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms