Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2f6O54917 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f6O54917 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f6O54917 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms