Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms