Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfrsf11aO35305 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfrsf11aO35305 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfrsf11aO35305 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfrsf11aO35305 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfrsf11aO35305 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfrsf11aO35305 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfrsf11aO35305 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf11aO35305 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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