Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ArxO35085 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms