Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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