Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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