Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms