Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5849J3QPE5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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