Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms