Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-1G3UXB3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-1G3UXB3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms