Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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