Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8247F6VRJ8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8247F6VRJ8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8247F6VRJ8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8247F6VRJ8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8247F6VRJ8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8247F6VRJ8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm8247F6VRJ8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Gm8247F6VRJ8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm8247F6VRJ8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm8247F6VRJ8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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