Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20518E9Q548 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms