Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc71lE9Q4T4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc71lE9Q4T4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc71lE9Q4T4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc71lE9Q4T4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc71lE9Q4T4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Ccdc71lE9Q4T4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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