Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Irf2bp2E9Q1P8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irf2bp2E9Q1P8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms