Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc1E9Q043 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms