Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb3D3Z6J4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms