Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Clrn2B2RVW2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Clrn2B2RVW2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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