Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms