Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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