Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms