Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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H2-M5A7VMS3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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H2-M5A7VMS3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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H2-M5A7VMS3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M5A7VMS3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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