Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms