Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms