Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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