Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm2A2A7B5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm2A2A7B5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms