Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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