Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrit3W8DXL4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrit3W8DXL4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms