Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3550W4VSN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3550W4VSN7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3550W4VSN7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms