Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdpk1Q9Z2A0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdpk1Q9Z2A0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdpk1Q9Z2A0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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