Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn8Q9Z260 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn8Q9Z260 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn8Q9Z260 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn8Q9Z260 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms