Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lgr5Q9Z1P4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr5Q9Z1P4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lgr5Q9Z1P4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lgr5Q9Z1P4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms