Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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Sh3bp5Q9Z131 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
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Sh3bp5Q9Z131 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bp5Q9Z131 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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Sh3bp5Q9Z131 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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Sh3bp5Q9Z131 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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Sh3bp5Q9Z131 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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Sh3bp5Q9Z131 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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Sh3bp5Q9Z131 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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Sh3bp5Q9Z131 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
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Sh3bp5Q9Z131 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bp5Q9Z131 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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Sh3bp5Q9Z131 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3bp5Q9Z131 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sh3bp5Q9Z131 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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