Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clip2Q9Z0H8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clip2Q9Z0H8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms