Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn3Q9Z0G9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn3Q9Z0G9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn3Q9Z0G9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn3Q9Z0G9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn3Q9Z0G9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn3Q9Z0G9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn3Q9Z0G9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn3Q9Z0G9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn3Q9Z0G9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms