Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam50bQ9WTJ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Fam50bQ9WTJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50bQ9WTJ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50bQ9WTJ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam50bQ9WTJ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Fam50bQ9WTJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam50bQ9WTJ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Fam50bQ9WTJ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms