Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TfebQ9R210 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TfebQ9R210 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TfebQ9R210 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms