Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim3Q9R1R2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim3Q9R1R2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms