Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trex2Q9R1A9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trex2Q9R1A9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms